Пятнадцатый полнометражный фильм начинается с серии угроз в адрес губернатора Токио. Конан Эдогава, используя свой дар дедукции и способность предвидеть смертельные опасности, чудом предотвращает взрыв в тоннеле метрополитена. Расследование приводит детектива к старой деревне, которую пришлось затопить при строительстве плотины, где скрывается мотивы преступника. Теперь гениальному школьнику нужно мчаться сломя голову, чтобы разгадать финальную загадку и остановить террориста до того, как он осуществит свою разрушительную атаку, грозящую всему городу.