В начале ХХI века в Антарктиде упал гигантский метеорит, что привело к таянию льдов и затоплению всех прибрежных территорий планеты. По крайней мере, так звучала официальная версия для общественности. Мир на время погрузился в хаос, но позднее постепенно восстановился. Это катастрофическое событие получило название Второй удар. Школьника Синдзи Икари вызвал к себе его отец Гэндо Икари, являющийся главой могущественной секретной организации Nerv. Под давлением отца и обстоятельств Синдзи начал пилотировать самое удивительное и разрушительное оружие людей — боевого робота Евангелион. На Токио-3, где находится штаб-квартира Nerv, напали странные существа, называемые Ангелами. Однако с течением времени Синдзи открывается страшная правда о Втором ударе, истинных целях Nerv и природе Ангелов. И его разум начинает медленно погружаться в пучины отчаяния. Это компиляция эпизодов сериала «Евангелион нового поколения» с несколькими переснятыми сценами и новым материалом.