Наступает середина декабря, и эксцентричная глава бригады SOS Судзумия Харухи с энтузиазмом объявляет, что Рождество они обязательно проведут в комнате клуба за праздничным ужином. Все члены SOS Brigade начинают активные приготовления к празднику. Однако спустя пару дней по дороге в школу рассказчик Кён начинает замечать пугающие странности: разговор с другом Танигути не вяжется, тот внезапно заявляет, что болен и вообще не помнит вчерашнего разговора. В классе нет Харухи, а Рёко Асакура, которая должна быть мертва, ожила и спокойно сидит на её месте, разговаривая с Кёном как ни в чём не бывало. Микуру Асахина смотрит на Кёна незнающим взглядом и не узнаёт его, а молчаливая Юки Нагато — обычная застенчивая девушка и единственный член литературного клуба. Ни бригады SOS, ни Харухи Судзумии в этой школе, похоже, никогда не существовало…