Финальный учебный год класса 3-E начинается с осознания того, что время на убийство Коро-сэнсэя истекает. Ученики стали сильнее, освоили новые технологии и тактики, но их учитель также не стоит на месте, готовя их к жизни после школы. Конфликт обостряется: правительство запускает финальную операцию по уничтожению монстра, используя любые средства, включая манипуляции и предательство. Ученикам предстоит сделать самый трудный выбор: выполнить миссию и спасти Землю или найти способ сохранить учителя, который дал им больше, чем просто знания. История подходит к эмоциональной развязке, где каждый должен ответить на вопрос: что значит быть убийцей и что значит быть учителем.