История рассказывает о недалёком будущем, когда Священная Британская Империя захватила почти половину мира, установив свою гегемонию. Японии в этом варианте истории больше не существует — она была завоёвана Британией годы назад, лишена независимости и переименована в унизительный «11-й сектор», а сами японцы презрительно называются «одиннадцатыми» и лишены всех прав. Главный герой, Лелуш Ламперуж, опальный принц императорского рода, был сослан вместе с слепой сестрой в 11-й сектор, где вынужден учиться в академии для местных аристократов под чужим именем. Волею случая он оказывается втянут в атаку японских повстанцев на британские войска. Империя, не терпящая никакого неповиновения, немедленно высылает карательные отряды, уничтожающие всё на своём пути без жалости. Спасаясь от имперцев, Лелуш пересекается с таинственной зеленоволосой девушкой, называющей себя С.С. Оказавшись загнанной в угол и окружённой солдатами, С.С. передаёт Лелушу Великий дар, называемый Гиасом — силу абсолютного подчинения. Теперь Империя заплатит за все свои преступления!