После событий дела «Потерянная Лоджия» Наноха терпеливо ожидает того дня, когда сможет воссоединиться со своей новой подругой Фейт, ставшей её союзником. Несмотря на то, что она исключительно могущественный маг, Наноха проводит деньки самым обычным образом — со своими друзьями на Земле, ходит в школу и наслаждается миром. Но мир вновь неожиданно пошатнулся, когда Наноха без какого бы то ни было предупреждения была атакована сильным и неизвестным магом. Группа жестоких магов нападает при помощи древней магии на всё подряд во имя целей, ведомых им одним, собирая артефакты любой ценой. Наноха и Фейт, вместе со своими друзьями — Юно, Арф, Хроно и агентами «Бюро пространства-времени» — снова должны объединиться в своей борьбе против магов-отступников, помешав им навредить чему-нибудь или кому-нибудь и раскрыть истинную причину их отчаянных действий. События являются прямым продолжением первого сезона.