История рассказывает о загадочном Аптекаре, путешествующем по феодальной Японии периода Эдо. Занимается он вовсе не торговлей лекарствами, сколько борьбой с мононокэ — разгневанными духами, причиняющими людям страдания. Единственным способом борьбы с мононокэ является особый магический клинок Аптекаря, для применения которого необходимо сперва раскрыть «Форму» духа, затем узнать глубокую «Суть» произошедших ранее трагических событий и наконец понять истинную «Причину» того, зачем пришел этот дух мстить. И лишь после выполнения всех трёх этих сложных условий страдающего мононокэ возможно будет освободить от проклятия, использовав клинок. Без знания этих трёх составляющих меч бессилен, и Аптекарь должен выступать в роли детектива, распутывая клубки человеческих эмоций и обид.