Спустя 13 лет возвращается история Сосукэ Сагары и Канамэ Тидори. Сосукэ, солдат организации «Мифрил», продолжает охранять Канамэ, обладающую способностью «Шепчущей», привлекающей внимание террористов. Баланс между школьной жизнью и военными операциями нарушается, когда Леонард Тестаросса, лидер враждебной группировки «Амальгама», начинает масштабное наступление. Героям предстоит столкнуться с новейшими боевыми машинами, раскрыть заговоры и пройти через огонь сражений, где цена ошибки — жизнь близких и судьба мира.