Во втором сезоне битва за Святой Грааль в городе Фуюки достигает своего апогея. Оставшиеся маги и их слуги — Сэйбер, Арчер, Райдер и другие — вступают в финальные схватки, где ставки максимально высоки. Сиро Эмия, следуя идеалам героя, сталкивается с суровой реальностью войны и мрачным отражением самого себя в лице Арчера. Рин Тосака вынуждена делать сложный выбор между долгом и чувствами. Город превращается в поле битвы, скрытое от глаз обычных людей, где решается судьба не только участников, но и самого мира. История подходит к кульминации, раскрывая истинную природу Грааля и цену желаний.