Действие фильма разворачивается через год после событий сериала. Ринтаро Окабэ, спасший Курису, начинает терять связь с реальностью из-за побочных эффектов постоянного чтения времени и воспоминаний о несуществующих мировых линиях. Он погружается в депрессию и забывает о своих друзьях. Тем временем Курису Макисэ, вернувшись в Японию, начинает испытывать странные ощущения дежавю, подсказывающие ей, что она забыла кого-то очень важного. Поняв, что Окабэ исчез из её памяти не просто так, она решает найти способ вернуть его сознание, рискуя вновь запустить цепь временных парадоксов, чтобы спасти любимого человека от забвения.