Юги Муто — хрупкий и застенчивый юноша, который обожает игры любого рода, особенно настольные. Но когда ему удаётся разгадать древнюю египетскую головоломку, известную как Millennium Puzzle, Юги пробуждает в себе силы тьмы, дремавшие тысячелетиями. Теперь, столкнувшись с опасностью и несправедливостью, он позволяет этой силе проявиться, превращаясь в уверенного и безжалостного игрока. В этой форме он приступает к сражениям за справедливость, наказывая злодеев в играх, где на кону стоят не просто очки, а сама судьба участников.