Агент Кей вербует новичка Джея в секретную организацию, известную как «Люди в черном». Их задача — регулировать деятельность инопланетян, скрывающихся на Земле среди людей, и защищать планету от межгалактических угроз. Организация использует высокотехнологичное оружие и стиратели памяти, чтобы сохранять тайну существования пришельцев. Героям предстоит предотвратить катастрофу, связанную с поиском мощного источника энергии, известного как «Галактика», который оказался спрятан в неожиданном месте.