Действие сериала разворачивается сразу после Войн клонов и рассказывает о приключениях отряда 99 — «бракованной партии» клонов. Члены этого уникального отряда генетически отличаются от своих собратьев по армии клонов — каждый из них обладает особенным навыком, который делает их чрезвычайно эффективными солдатами и грозной командой. Они начинают работать в качестве наемников и стараются найти свой путь в быстро меняющейся галактике.